香港回归后，特区政府经历了多次重大管治与社会危机冲击。完善香港治理体系和治理效能，不仅需要中央行使全面管治权，而且需要特区政府强化治理能力。近年来，通过香港国安法的制定实施、香港选举制度的修改完善、“爱国者治港”根本原则的有效落实、香港重要管治力量（选委会、立法会）的重建等举措，香港逐步形成了新管治架构。这些举措是在制度层面解决“谁治理”的问题，在治理体系运行层面“如何治理”和“治理得怎样”的问题亟待解决。香港治理体系在治理效能、领导能力、社会信任等方面仍有制度性弊端。对此的解决重点是改革香港行政官僚体制，特区政府行政官僚系统内要组建一个爱国、团结并有远见、魄力、担当的管治队伍；强化管治队伍的治理能力；完善公务员队伍的问责制度及考核与激励机制。香港行政官僚体系深受港英政府政治文化影响，存在规范性缺失。对此的解决重点是重建香港行政官僚系统与国家的情感链接，真正确立对国家的政治忠诚。未来，要继续深化行政官僚体系改革，进一步落实中央关于提高香港治理能力和水平的决定，切实树立中央的管治权威，开始香港从“由乱到治”迈向“由治及兴”的新篇章。